Le doctorat se prépare sous la responsabilité d'un directeur de thèse habilité à diriger des recherches, dans une équipe d'accueil d'une école doctorale. Le suivi administratif des doctorants est assuré par la responsable administrative, gestionnaire de l'école doctorale concernée.
Le doctorat se prépare souvent en prolongation de l'obtention du grade de master ou d'un équivalent, en principe sur une durée de trois ans.
En cours de carrière, le doctorat peut se préparer par la démarche de "validation des acquis de l'expérience" (VAE) ou sous forme de thèse sur travaux.